El acuario más grande del mundo, como la bautizó el famoso biólogo y explorador Jacques Cousteau, es el sitio ideal para los amantes del buceo. Sin embargo, no es necesario ser un buzo experto para usar visor y esnorkel y adentrarse en aguas someras donde un guía puede llevarlo a disfrutar de la vida submarina para observar erizos, caracoles, estrellas de mar y peces de colores en su propio hábitat. No es raro encontrarse también con grupos de delfines o ballenas piloto.

        Durante ciertas épocas del año es posible bucear dentro de la Bahía de La Paz con tiburón ballena y tiburón martillo, así como con mantarrayas gigantes. El clima único del Mar de Cortés, vientos y fuertes corrientes, hacen florecer el plancton que atrae a cientos de especies marinas para alimentarse. Las zonas de El Bajo, Los Islotes, Las Ánimas, La Reina y La Reinita,  aledañas a las islas son ideales para el buceo. Las temporadas más recomendables para estas actividades son la primavera y el verano pero algunos de estos lugares pueden disfrutarse en cualquier época del año. Espíritu Santo, por ejemplo, cuenta con un arrecife artificial, ya que el buque Salvatierra fue hundido con ese propósito desde 1999, y la zona de la lobera en la punta de Isla Partida que ofrece la experiencia de bucear con los lobos marinos (los más jóvenes se acercan a jugar y nadar con los buzos).

        Partiendo desde el muelle turístico de La Paz o desde la playa El Tecolote, los prestadores de servicios lo llevarán a un recorrido de buceo y esnorkel de acuerdo a sus gustos y preferencias.

        Baja California Sur es el Estado con mayor extensión de litorales: 2,230 km y, por supuesto, con una cantidad increíble de escenarios para practicar infinidad de deportes y actividades acuáticas.

        El kayac, para principiantes o profesionales, puede practicarse desde la ensenada de La Paz, las playas cercanas a la ciudad o para quienes busquen los paisajes más espectaculares, alrededor de las Islas. El agua de la Bahía es transparente y tranquila la mayor parte del año y provoca la sensación de deslizarse sobre la vitrina de un acuario.

Para practicar windsurf, kitesurf o veleo, además de la Bahía, las zonas ideales son La Ventana y El Sargento, lugares en donde los vientos favorecen estos deportes.

        Las olas grandes, la delicia de todo fanático del surf, se encuentran en las playas Pescadero y Los Cerritos, cercanas a Todos Santos. En éstas además se disfruta de una excelente zona para acampar con clima templado y atardeceres espectaculares. El surf es una actividad que poco a poco ha ganado más seguidores en el país y estas playas reciben a lo largo del año a decenas de deportistas de todo el mundo.